W każdym zbiorniku zamkniętym, w którym nie następuje ciągła wymiana wody istnieje ryzyko gromadzenia się różnego rodzaju szkodliwych substancji. Problem ten dotyczy oczywiście każdego akwarium. Miłośnicy akwarystyki muszą stale zmagać się z ryzykiem zaburzenia naturalnej równowagi chemicznej i biologicznej w wodzie. Jest to bardzo poważna kwestia, bowiem niektóre substancje przy zbyt wysokim stężeniu mogą być dla rybek śmiertelnie niebezpieczne. Na szczęście istnieje wiele sposób na unikanie takich zagrożeń. Istotna jest przede wszystkim regularna wymiana wody w akwarium.
Często nie chodzi jednak o całkowitą wymianę, a jedynie podmienianie określonej jej części. W ten sposób z jednej strony zapewnia się rybkom dostęp do świeżej wody, a z drugiej – nie zaburza naturalnego ekosystemu, jaki powstaje w akwarium. Oprócz tego korzysta się z rozwiązań takich jak węgiel do akwarium. W sklepach znaleźć można całe mnóstwo różnych typów filtrów oraz substancji filtrujących wodę. Ich stosowanie jest niezbędne, bowiem jedynie w ten sposób można na bieżąco usuwać z wody wszystkie zanieczyszczenia.